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Bactérias heterotróficas neutrofílicas e acidófilas compõem a maioria das espécies de bactérias. Os termos "neutrofílico" e "acidofílico" referem-se ao nível ótimo de pH das espécies bacterianas - uma medida da acidez ou basicidade de uma substância. Por exemplo, o vinagre mede como ácido e o bicarbonato de sódio como base. A escala de pH varia de 0 a 14, com 7, o pH da água pura, bem no meio.
Heterotróficos neutrofílicos
A maioria das bactérias, neutrófilos, vive no solo ou na água e cresce melhor com um pH neutro entre 6 e 8. Se o pH varia muito fora desse intervalo, as bactérias neutrófilas não podem sobreviver. A maioria das bactérias que causam doenças nos seres humanos também é heterotrófica neutrofílica, adequada para sobreviver dentro do corpo humano.
Heterotróficos acidófilos
As bactérias acidófilas crescem melhor em níveis mais baixos de pH, geralmente abaixo de 6, pois possuem mecanismos biológicos que lhes permitem manter o pH interno quase neutro. A drenagem ácida de minas - o escoamento contaminado e altamente ácido das áreas de mineração - contém uma alta população de acidófilos que oxidam o sulfeto encontrado nos minérios metálicos. De acordo com o Science Education Resource Center do Carleton College, o ferroplasma acidófilo encontrado na drenagem ácida de minas exibia níveis de pH tão baixos quanto zero.
Heterotróficos acidófilos obrigatoriamente
Os acidófilos obrigatórios requerem um pH baixo, abaixo de 4 ou 5, para sobreviver. A membrana celular dos acidófilos obrigatórios realmente se dissolve em níveis neutros de pH, causando a morte celular. Muitos acidófilos obrigatórios também são termófilos - organismos que crescem melhor em altas temperaturas - e comumente encontrados em solos vulcânicos. O Thiobacillus ferrooxidans provavelmente é considerado a bactéria acidofílica oxidante de ferro mais frequentemente estudada.