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Quantifique sua amostra de RNA medindo sua absorbância da luz ultravioleta (UV). Um espectrofotômetro de gota nano usará apenas um ou dois microlitros da sua amostra, que você pode recuperar. Outros espectrofotômetros requerem uma amostra muito maior. O coeficiente de extinção para nucleotídeos no comprimento de onda UV de 260 nm em um caminho de luz de 1 cm é 20. Com base nesse coeficiente de extinção, a absorvância de 40 µg / ml de RNA sob as mesmas condições é uma. Usando essas informações, você pode calcular a concentração da sua amostra de RNA.
Faça uma diluição, se necessário, da sua amostra. Uma diluição padrão para uma microcuveta é 1:40. Faça esta diluição adicionando 2 µL de amostra de RNA a 78 µL de água estéril.
Siga os protocolos do seu espectrofotômetro específico para calibrar a máquina usando um espaço em branco e, em seguida, determine a densidade óptica da sua amostra com um comprimento de onda UV de 260 nm.
Multiplique a absorvância da sua amostra pelo seu fator de diluição por 40μg de RNA / mL. A equação seria: “Concentração de RNA (µg / ml) = (DO260) x (fator de diluição) x (40µg de RNA / ml) / (1 unidade de OD260)” (Hofstra.edu) Por exemplo: Se você diluiu sua amostra por 1:40 e sua leitura de absorvância era 0,08, você multiplicaria 0,08 x 40 x 40 = 128 µg / ml = 0,13 µg / μL
Descubra a pureza da sua amostra fazendo outra leitura de absorvância no comprimento de onda UV de 280 nm. A razão OD 260 / DO 280 indicará se - e em que nível - sua amostra está contaminada com proteína ou fenol. Um resultado de 1,8 a 2,0 indica RNA de qualidade.