Contente
- Cinética enzimática
- Cinética Michaelis-Menten
- Vinculação Cooperativa
- A equação de Hill
- O coeficiente de Hill
"Coeficiente de Hill" soa como um termo que pertence à inclinação de uma série. De fato, é um termo em bioquímica que se relaciona com o comportamento da ligação de moléculas, geralmente em sistemas vivos. É um número sem unidade (ou seja, não possui unidades de medida como metros por segundo ou graus por grama) que se correlaciona com a Cooperatividade da ligação entre as moléculas sob exame. Seu valor é determinado empiricamente, o que significa que é estimado ou derivado de um gráfico de dados relacionados, em vez de ser usado para ajudar a gerar esses dados.
Em outras palavras, o coeficiente de Hill é uma medida da extensão em que o comportamento de ligação entre duas moléculas se desvia do hiperbólico relação esperada nessas situações, em que a velocidade da ligação e a reação subsequente entre um par de moléculas (geralmente uma enzima e seu substrato) inicialmente aumentam muito rapidamente com o aumento da concentração do substrato antes que a curva velocidade versus concentração se achatar e se aproximar de uma máximo teórico sem chegar lá. O gráfico dessa relação se assemelha bastante ao quadrante superior esquerdo de um círculo. Os gráficos das curvas velocidade versus concentração para reações com altos coeficientes de Hill são sigmoidalou em forma de s.
Há muito o que descompactar aqui em relação à base para o coeficiente de Hill e termos relacionados e como determinar seu valor em uma determinada situação.
Cinética enzimática
As enzimas são proteínas que aumentam as taxas de reações bioquímicas específicas em enormes quantidades, permitindo que elas procedam de milhares de vezes mais rapidamente a milhares de trilhões de vezes mais rápido. Essas proteínas fazem isso diminuindo a energia de ativação Euma de reações exotérmicas. Uma reação exotérmica é aquela em que a energia térmica é liberada e, portanto, tende a prosseguir sem nenhuma ajuda externa. Embora os produtos tenham uma energia mais baixa que os reagentes nessas reações, no entanto, o caminho energético para chegar lá normalmente não é uma inclinação descendente constante. Em vez disso, existe um "choque de energia" a ser superado, representado por Euma.
Imagine-se dirigindo do interior dos EUA, cerca de 1.000 pés acima do nível do mar, para Los Angeles, que fica no Oceano Pacífico e claramente ao nível do mar. Você não pode simplesmente costa de Nebraska à Califórnia, porque, entre as Montanhas Rochosas, as rodovias que cruzam mais de 5.000 pés acima do nível do mar - e em alguns pontos, as rodovias sobem até 11.000 pés acima do nível do mar. Nessa estrutura, pense em uma enzima como algo capaz de diminuir bastante a altura dos picos das montanhas no Colorado e tornar a jornada inteira menos árdua.
Toda enzima é específica para um determinado reagente, chamado de substrato neste golpe. Dessa maneira, uma enzima é como uma chave e o substrato específico é como a fechadura que a chave foi projetada para abrir com exclusividade. A relação entre substratos (S), enzimas (E) e produtos (P) pode ser representada esquematicamente por:
E + S ⇌ ES → E + P
A seta bidirecional à esquerda indica que quando uma enzima se liga ao substrato "atribuído", ela pode se libertar ou a reação pode prosseguir e resultar em produto (s) mais a enzima em sua forma original (as enzimas são modificadas apenas temporariamente enquanto reações catalisadoras). A seta unidirecional à direita, por outro lado, indica que os produtos dessas reações nunca se ligam à enzima que ajudou a criá-las quando o complexo ES se separa em suas partes componentes.
A cinética enzimática descreve a rapidez com que essas reações terminam (isto é, a rapidez com que o produto é gerado (em função da concentração de enzima e substrato presente, escrita e escrita). Os bioquímicos criaram uma variedade de gráficos desses dados para torná-lo visualmente possível.
Cinética Michaelis-Menten
A maioria dos pares enzima-substrato obedece a uma equação simples chamada fórmula de Michaelis-Menten. Na relação acima, três reações diferentes estão ocorrendo: a combinação de E e S em um complexo ES, a dissociação de ES em seus constituintes E e S e a conversão de ES em E e P. Cada uma dessas três reações tem sua constante de taxa própria, que são k1k-1 ek2, naquela ordem.
A taxa de aparecimento do produto é proporcional à taxa constante para essa reação, k2, e à concentração do complexo enzima-substrato presente a qualquer momento,. Matematicamente, isto está escrito:
dP / dt = k2
O lado direito disso pode ser expresso em termos de e. A derivação não é importante para os propósitos atuais, mas isso permite o cálculo da equação da taxa:
dP / dt = (k20) / (Km+)
Da mesma forma, a taxa da reação V é dada por:
V = Vmax/ (Km+)
A constante Michaelis Km representa a concentração de substrato na qual a taxa prossegue em seu valor máximo teórico.
A equação Lineweaver-Burk e o gráfico correspondente são uma maneira alternativa de expressar a mesma informação e são convenientes porque seu gráfico é uma linha reta, em vez de uma curva exponencial ou logarítmica. É o recíproco da equação de Michaelis-Menten:
1 / V = (Km+) / Vmáx = (Km/ Vmax) + (1 / Vmax )
Vinculação Cooperativa
Algumas reações notavelmente não obedecem à equação de Michaelis-Menten. Isso ocorre porque sua ligação é influenciada por fatores que a equação não leva em consideração.
A hemoglobina é a proteína nos glóbulos vermelhos que se liga ao oxigênio (O2) nos pulmões e transporta-o para os tecidos que requerem respiração. Uma propriedade notável da hemoglobina A (HbA) é que ela participa da ligação cooperativa com O2. Isso significa essencialmente que em altitudes muito altas2 Em concentrações, como as encontradas nos pulmões, a HbA tem uma afinidade muito maior pelo oxigênio do que uma proteína de transporte padrão, obedecendo à relação hiperbólica usual entre proteína e composto (a mioglobina é um exemplo dessa proteína). A muito baixo O2 concentrações, no entanto, HbA tem uma afinidade muito menor para O2 do que uma proteína de transporte padrão. Isso significa que o HbA engole avidamente O2 onde é abundante e o abandona com tanta avidez onde é escasso - exatamente o que é necessário em uma proteína de transporte de oxigênio. Isso resulta na curva de ligação versus pressão sigmoidal observada com HbA e O2, um benefício evolutivo sem o qual a vida certamente continuaria em um ritmo substancialmente menos entusiasmado.
A equação de Hill
Em 1910, Archibald Hill explorou a cinemática de O2ligação à hemoglobina. Ele propôs que a Hb tenha um número específico de sites de ligação, n:
P + nL ⇌ PLn
Aqui, P representa a pressão de O2 e L é abreviação de ligante, que significa qualquer coisa que participe da ligação, mas, neste caso, refere-se a Hb. Observe que isso é semelhante a parte da equação substrato-enzima-produto acima.
A constante de dissociação Kd para uma reação está escrita:
n /
Considerando que a fração dos locais de ligação ocupados ϴ, que varia de 0 a 1,0, é dada por:
ϴ = n/ (Kd +n)
Juntar tudo isso fornece uma das muitas formas da equação de Hill:
log (ϴ /) = n log pO2 - log P50
Onde P50 é a pressão na qual metade do O2 locais de ligação em Hb estão ocupados.
O coeficiente de Hill
A forma da equação de Hill fornecida acima é da forma geral y = mx + b, também conhecida como fórmula de interceptação de inclinação. Nesta equação, m é a inclinação da reta eb é o valor de y no qual o gráfico, uma linha reta, cruza o eixo y. Assim, a inclinação da equação de Hill é simplesmente n. Isso é chamado de coeficiente de Hill ou nH. Para a mioglobina, seu valor é 1 porque a mioglobina não se liga cooperativamente a O2. Para HbA, no entanto, é 2,8. Quanto maior o nH, mais sigmoidal será a cinética da reação em estudo.
O coeficiente de Hill é mais fácil de determinar a partir da inspeção do que fazendo os cálculos necessários, e uma aproximação geralmente é suficiente.