Como calcular o Audpc

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Autor: Laura McKinney
Data De Criação: 3 Abril 2021
Data De Atualização: 1 Julho 2024
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Como calcular a AACPD no R
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A área sob a curva de progresso da doença (AUDPC) é uma medida quantitativa da intensidade da doença com o tempo. É usado em patologia de plantas para indicar e comparar níveis de resistência a doenças entre variedades de plantas. O método trapézio. É a maneira mais comum de calcular o AUDPC. É realizada usando uma fórmula elaborada por Campbell e Madden em 1990 ou plotando um gráfico de porcentagem de infecção contra o tempo e somando os trapézios entre os intervalos de tempo.

Medir a progressão da doença

    Regras e diretrizes de pesquisa que se aplicam à medição da doença e cultura específicas que você investiga. O tamanho necessário da amostra de planta varia de acordo com a colheita e a doença. Estudar a praga tardia em tubérculos, por exemplo, requer uma amostra mínima de 40 plantas.

    Plante o número apropriado de plantas necessárias para o estudo.

    Observe atentamente os sinais da doença. Pesquise quando os sinais devem ocorrer para que você esteja preparado. Por exemplo, os sinais de queima tardia ocorrem cerca de 30 a 40 dias após o plantio e 10 dias após a última aplicação do fungicida.

    Estime visualmente a porcentagem de área foliar infectada em sua amostra assim que notar a doença.

    Registre a porcentagem de área foliar infectada em intervalos regulares. Pesquisadores fazem a leitura da praga a cada sete dias se a doença progride mais rapidamente do que o esperado. As leituras são feitas a cada 14 dias quando a progressão da doença é mais lenta.

    Pare de registrar as medições de infecção quando a porcentagem de infecção parar de aumentar e os níveis de progressão da doença.

Calcular AUDPC a partir de uma equação

    Adicione as duas primeiras porcentagens de infecção que você registrou.

    Divida o resultado da adição por dois para encontrar o valor médio ou médio das duas leituras.

    Multiplique a média ou o valor médio pelo intervalo de tempo, que é o número de dias desde a primeira leitura até a segunda leitura. Se você fez a primeira leitura no dia 20 e a segunda no dia 27, por exemplo, o número de dias ou o intervalo de tempo é de sete dias.

    Registre o resultado em unidades de porcentagem de dias. O valor é uma área de um trapézio.

    Repita as etapas de um a quatro para as segunda e terceira leituras de infecção que você fez. O resultado será a área de um segundo trapézio. Repita as etapas de um a quatro até calcular as áreas trapezoidais para todas as leituras.

    Adicione todos os trapézios para encontrar o AUDPC. AUDPCs mais baixos representam progressão mais lenta da doença e maior resistência à doença. AUDPCs mais altos representam uma progressão mais rápida da doença e maior suscetibilidade à doença.

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