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Como a maioria dos biomas da Terra, o ecossistema da savana sobrevive em um delicado equilíbrio entre fatores ambientais e várias espécies, incluindo seres humanos. A seca severa pode roubar essas pastagens de água e folhagem que dão vida, enquanto caçadores e povos indígenas muitas vezes ameaçam perturbar a cadeia alimentar através da matança de animais para esporte ou sobrevivência.
Atividades humanas
As atividades humanas podem ameaçar gravemente perturbar os ecossistemas da savana. O uso insustentável da água e os métodos de irrigação podem secar os rios e os poços de água que dão vida. Nas regiões onde os povos indígenas incluem regularmente carne de animais silvestres - carne selvagem - em suas dietas, as populações de ungulados caíram a taxas visíveis. Alguns animais selvagens da savana também são caçados como troféus; rinocerontes negros, em particular, são caçados por seus valiosos chifres. Mesmo algumas espécies de plantas são super-colhidas devido ao seu valor comercial. Esculturas feitas de Blackwood Africano, uma árvore de savana, são frequentemente vendidas nos mercados de turistas.
Seca e pastagem pesada
Seca prolongada e severa tem um efeito perigoso em um ecossistema de savana, com padrões de pastoreio exacerbando esse efeito. A combinação de seca e pastagem severa pode alterar uma pastagem de gramíneas perenes e principalmente comestíveis para uma savana dominada por gramíneas e plantas não comestíveis. Pradarias levemente pastadas mantêm sua qualidade de espécies de gramíneas perenes e palatáveis, mas a composição de espécies vegetais ainda pode ser alterada. Especialistas pediram soluções de manejo de pastoreio durante episódios de seca para afetar a direção de possíveis mudanças em direção à sustentabilidade das pastagens.
Desertificação
As savanas tropicais costumam fazer fronteira com regiões áridas e desérticas, e a disseminação de condições desérticas em áreas de pastagem seca é chamada desertificação. Essa ameaça a um ecossistema de savana inclui efeitos causados por mudanças climáticas, práticas agrícolas, pastoreio excessivo, irrigação agrícola agressiva, o que reduz o nível do lençol freático longe das raízes das plantas, desmatamento e erosão. A cada ano, mais de 46.000 quilômetros quadrados de savana africana se tornam desertos. O plantio de plantas resistentes à seca pode estabilizar a mudança das dunas e iniciar a proliferação de vegetação adicional.
Emissões de carbono
Uma pesquisa de 2012 atribuiu grandes aumentos na massa de plantas lenhosas ao "efeito de fertilização de CO2". Os autores afirmaram que o aumento na taxa de crescimento de plantas lenhosas foi causado pelo aumento do dióxido de carbono atmosférico. Um aumento dramático na quantidade de árvores e arbustos pode ameaçar todo o ecossistema da savana, já que essas plantas usam mais água do que gramíneas. Conservacionistas na Namíbia têm relatado que as plantas lenhosas têm impedido o antílope e os guepardos que os caçam - um desenvolvimento que pode ter repercussões desconhecidas nas pastagens.